Massaspectrometrie (MS) is een belangrijke analysetechniek voor de identificatie en structuuropheldering van biomoleculen. Niet alleen is met massaspectrometrie het molecuulgewicht van een verbinding te bepalen, maar men kan uit een fragmentatiespectrum ook informatie halen over de functionele groepen van een verbinding en vaak ook over de structuur. De toepassing van MS is breed: het wordt gebruikt om kleine organische moleculen in kaart te brengen, eiwitten te bestuderen, en zelfs om eiwitcomplexen of hele cellen te analyseren. Doordat met MS gemeten kan worden hoe dit scala aan biomoleculen verandert als functie van hun cellulaire omgeving, is het een van de belangrijkste analytisch chemische methodes in het biologische en biomedische onderzoek.

In deze cursus maak je kennis met de theoretische achtergronden van de massaspectrometrie en van de fundamentele processen die in een massaspectrometer plaatsvinden. Daarnaast leer je hoe massaspectrometrie toegepast wordt in het biologische en (bio)medische onderzoek. Daarbij ligt de nadruk op drie technieken: Metabolomics (het meten van kleine organische moleculen), Proteomics (het meten en de identificatie van eiwitten) en MS toepassingen in de structuur biologie (het meten van intacte eiwitten en eiwitcomplexen). Tevens wordt aandacht besteed aan de praktische aspecten van MS, zoals het interpreteren van spectra, database searching en bioinformatica.

Massaspectrometrie en Proteomics is onderdeel van de leerlijn Biochemie en sluit aan op biomoleculaire chemie niveau 1. De leerlijn Ethiek en Maatschappij komt in de cursus ook aan bod.

Inhoudelijk zijn er een verplichte Journal Club opdracht en een Open Data opdracht (voor de leerlijn Ethiek en Maatschappij) toegevoegd. Voor beide opdrachten geldt een deelnameplicht, zonder cijfer in de eindbeoordeling.