Leerdoelen
Aan het eind van de cursus heb/kun je:
- inzicht in de functie van het immuunsysteem, op het niveau van het boek The Immune System (Parham).
- kennis van het selecteren en verwerken van immunologische literatuur,
- een immunologisch onderwerp/probleem eigen maken en uitdiepen aan de hand van primaire literatuur.
- kennis van het gebruik van wiskundige modellen en bioinformatica in immunologisch onderzoek.
- een glimp van de actuele stand van zaken en ontwikkelingen in het huidige immunologische onderzoek.
Vaardigheden
- het zelfstandig interpreteren van primaire literatuur en het verder verzamelen van gerelateerde informatie uit ander informatiebronnen,
- het kunnen samenvatten en presenteren van complexe beschrijvingen van immune systemen en hun werking en regulatie,
- het gebruik van basis bioinformatica en wiskundige modellen,
- databases gebruiken met betrekking tot het vinden van gegevens over genen en genomen voor immunologisch onderzoek.
- samenwerken en komen tot een gezamenlijk product (presentaties en rapporten),
- rapporteren,
- houden van een presentatie.
|
 |
|
Ingangseisen
Eén van de volgende N2 cursussen van de bacheloropleiding Biologie of kennis die daarmee vergelijkbaar is: De Cel, Metabolisme (Metabolisme en Biochemie) of Ontwikkelingsbiologie. Daarnaast is het zeer aanbevolen om een van de volgende N2 cursussen van de bacheloropleiding Biologie te volgen (of op een andere manier verkregen vergelijkbare kennis): Data Science en biologie of Voortgezette statistiek en R.
Voor MLS studenten met weinig of geen ervaring met R-programeertaal geldt dat zij tenminste een maand voor aanvang van de cursus contact dienen op te nemen met de cursuscoordinator om zelfstudie materiaal te ontvangen.
Studiepad
Dit is een kerncursus van het studiepad Theoretische Biologie en Bioinformatica. De cursus wordt aanbevolen voor Celbiologie, Microbiologie, Ontwikkelingsbiologie en Toxicologie.
Inhoud
Het immuunsysteem omvat aangeboren en verworven defensiemechanismen tegen (pathogene) micro-organismen. Het eerste deel van de cursus brengt je begrip van het immuunsystem op een basisniveau. In de vorm van hoorcolleges krijg je stapsgewijs inzicht in de opbouw en de wijze van functioneren van het menselijk afweersysteem.
Het immunesysteem kenmerkt zich door zijn grote diversiteit. Dit aspect vormt het centrale thema in de cursus. De immunologische processen en mechanismen die leiden tot een adequate afweer tegen bacteriën en virussen krijgen de meeste aandacht. Je leert bijvoorbeeld de structuur van antistoffen kennen en de basis van antistof-variabiliteit, effector-functies van antistoffen, functies van lymfocyten, antigeen-presenterende cellen en de functie van eiwitten van het major histocompatibiliteits complex, en immunologische tolerantie.
Gedurende de cursus leert je wiskundige modellen begrijpen en analyseren en met basis bioinformatica methoden te voorspelen welke stukken van een virus of bacterie het meest immunogeen zijn.
Werkvormen
Hoor- en werkcollege (computer), artikel presentaties en discussie sessies. Black board pagina van het cursus is een belangrijk hulpmiddel tijdens de cursus. Hierop staat alle voor de cursus nodige informatie, en de opdrachten.
Toetsing
Actieve deelname aan de computeropdrachten is verplicht. Dit wordt getest in de vorm van een lab-boek, die in het eind van de cursus moet ingeleverd worden. De hoorcolleges zijn hiervoor onontbeerlijk.
De beoordeling vindt plaats door twee schriftelijke toetsen (60%), artikel
presentaties, en discussie of debat (15%), wekelijks blackboard toetsen (10%), en een poster presentatie over computer werkcolleges (15%). Het gemiddelde cijfer voor de twee toetsen mag niet lager dan 5,5 zijn.
Studiemateriaal
- Boek: The immune system, by Peter Parham, fourth edition, 2014, Garland Science, (het boek is verplicht bij de cursus),
- Primaire literatuur
|
|
|