SluitenHelpPrint
Switch to English
Cursus: SK-B2NMRM
SK-B2NMRM
NMR-spectroscopie en molecular modelling
Cursus informatie
CursuscodeSK-B2NMRM
Studiepunten (EC)7,5
Cursusdoelen
Na afronding van de cursus heeft de student:
·         begrip gekregen van moleculaire modellering en specifieke toepassingen ervan binnen de scheikunde en levenswetenschappen (met een accent op klassieke methoden)
·         inzicht in de keuzes die men moet maken om een systeem goed te modelleren (b.v.: Welke vrijheidsgraden zijn relevant om een bepaald probleem te kunnen oplossen? Hoe beschrijf ik de interactie tussen deeltjes? Welke conformationele zoekmethode is het meest geschikt voor mijn probleem?)
·         ervaring opgedaan met het modelleren van (bio)chemische systemen op computers met behulp van verschillende software
·         kennis van de basisprincipes van en apparatuur nodig voor NMR spectroscopie en analyses van NMR data
·         inzicht in hoe magnetische resonantietechnieken toegepast worden in verschillende medische en chemische disciplines, met name de structuurbiologie
Na afronding van de cursus is de student in staat:
·         om de beste modelleringsmethode de kiezen voor een bepaalde toepassing
·         om experimentele data met modellen te combineren om een probleem op te lossen
·         om multidimensionele NMR spectra toe te kennen
·         modelling en NMR data die in de literatuur beschreven is te begrijpen en te beoordelen
Inhoud
Deze cursus behandelt de principes van moleculaire modellering en NMR spectroscopie. Beide hebben brede toepassingen binnen scheikunde, levenswetenschappen en materiaalkunde.
 
Het onderdeel moleculaire modellering concentreert zich op klassieke modelleringsmethodes (dus geen kwantum beschrijving) voor toepassing op biologische moleculen. De student leert hoe moleculen, hun interacties en energetica kunnen worden beschreven in een computer, en verschillende methoden om de conformatieruimte te doorzoeken naar energie minima. Deze technieken worden vaak toegepast in structuur biologie (b.v. Röntgen-crystallografie en NMR) om structuren van eiwitten te berekenen op basis van experimentele gegevens.
 
In het onderdeel NMR worden de basisprincipes van de techniek uitgelegd alsmede de verschillende fenomenen die aan de basis liggen van NMR experimenten en de daaraan gerelateerde observables, en de brede toepassingen van NMR in analytische chemie, levenswetenschappen en materiaalkunde en imaging.
In het computer practicum komen NMR en moleculaire modellering samen om op basis van NMR data de structuur van een biomoleculaire complex de voorspellen.
SluitenHelpPrint
Switch to English